内蒙古大学创建于1957年，是新中国成立后在少数民族地区最早创立的一所综合性大学，在国家高等教育布局中具有重要作用和特殊区域定位。英国《简明大不列颠百科全书》曾把内蒙古大学列为中国15所著名大学之一。时任国务院副总理、内蒙古自治区主席乌兰夫任首任校长，原高教部综合大学司副司长于北辰任副校长，中科院学部委员、著名生物学家、北京大学一级教授、耶鲁大学博士李继侗先生来校执教并任学术副校长。党和政府从北京大学等国内著名高校，选派一批知名学科带头人和学术骨干组成了建校初期高起点的师资队伍，为后续发展奠定了坚实的办学基础和优良的学风校风。

学校1962年招收研究生，1978年被确定为全国重点大学，1984年获博士学位授予权，1997年被批准为国家“211工程”建设院校，2004年成为内蒙古自治区人民政府和国家教育部共建院校，2012年成为“中西部高校综合能力提升工程”14所重点建设院校，2013年与郑州大学、贵州大学、云南大学、山西大学等高校成立“中西部高校联盟”，并成为14个成员之一。